Es el principal material utilizado en la síntesis de ácidos grasos, y el resultado inicial de su degradación oxidativa. Mientras que la degradación se realiza en la mitocondria, la síntesis es extramitocondrial. Esto supone un problema para el suministro de acetil-CoA para el proceso de síntesis, ya que la membrana mitocondrial es impermeable, y además, como proviene de la oxidación del piruvato, también se verifica en el interior de la mitocondria. El transporte se realiza de diversas maneras: (a) como acetato que pasaría después a acetil-CoA por la acción de la acetato tiocinasa; (b) como citrato que puede escindirse dando lugar a acetil-CoA y oxalacetato (actuando la ATP-citrato liasa) y (c) utilizando como vehículo la carnitina, mediador en el transporte de grupos acilo a través de membranas mitocondriales.
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